Huvudskillnad: Shia är en av de två stora sekterna i islam, den andra är sunnin. Ismaili är en division inom shia sekten. Uppdelningen beror på valet av en Imam.
Innan du förstår hur Shias delas in i dessa tre grenar, är det viktigt att förstå hur skillnaderna mellan sunni och shia bildades. Under Muhammad betraktades alla muslimer som en. Muhammad anses vara Guds sista profet. Skillnaderna följde Muhammeds död. Muhammad dog utan att officiellt förklara en arving för att leda den muslimska gemenskapen. Det fanns två huvuddragare: Abu Bakr (Muhammads svärfar) och Ali (Muhammeds kusin och svärson). Sunni plockade Abu Bakr, som var en vän och en förtroende för Muhammad som en kalif för ledning och rådgivning. Men shiaerna trodde att kalifatet skulle förbli inom Muhammeds familj och därmed föredrog Ali som ledare. Ali blev det fjärde kalifatet under sunniska stycket. Förutom dessa finns det andra små skillnader vad gäller hur de ber och vad de tror. På grund av dessa skillnader mellan Shia och Sunni har det ständigt kollat mellan islamens två sekter.
Shia mötte också några inre meningsskiljaktigheter angående imamerna och vem ska leda som en Imam. Under Shia islam anses en Imam som en ledare som tittar på vägledning för alla aspekter av livet. Enligt Shia-doktrinen är Imamah en gudomlig institution som lyckades institutionen för profetisk mat. De tror att imamerna väljs och plockas av gudomliga varelser, de har fullständig kunskap och kan med rätta tolka Quranan. Nu skiljer skillnaden mellan shia på grund av valet av imamer. Ismaili är en gren av Shia islam som heter Ismail ibn Ja'far, som de tror är rättmässigt utsedd Imam eller andlig efterträdare. Detta skiljer sig från de Twelvers som tror Mūsà al-Kāżim, Ismails yngre bror som den sanna Imam.
Ismailism var vid en tidpunkt den största gren av Shisim som var i politisk makt under tio och tolfte århundraden. Eftersom ismalismen är en gren och en del av shiasen, delar de båda många övertygelser, däribland att det bara finns en sann gud och att imamer ska vara avkomlingar till Muhammad genom hans dotter, Fatima. Både, Shias och Ismaili tror att familjen Muḥammad (Ahl al-Bayt) som gudomligt vald, ofelbar och styrd av Gud för att leda det islamiska samhället.
Nizari Ismaili är en väg (tariqah) av shia islam som betonar social rättvisa, pluralism och mänsklig anledning inom ramen för Islamas mystiska tradition. Det anses vara den näst största gren av islam och utgör majoriteten av Ismaili. Mustaali Ismaili är en sekt av Ismaili Shia Islam. Huvudskillnaden mellan Nizari Ismaili och Mustaali Ismaili är vem som borde ha ledt som Imam. Nizaris accepterade Imam Nizar (den första) som den nittonde Imam, medan Mustaalis anser Nizars yngre bror Mustali. Nizari-muslimerna är för närvarande ledd av Aga Khan IV, som är känd som Imam Shah Karim.
Enligt Wikipedia, "Musta'liyyahen kallas också Taiyabi eller Ṭayyibī, efter den sista Imam som de känner igen, Ṭayyib Abī l-Qāṣim. Historiskt var det en skillnad mellan Ṭayyibiyyah och Ḥāfiziyyah, den senare erkände Egyptens Fatimid-härskare (mellan 1130-1169) som legitima Imāms, och inte Ṭayyib Abī l-Qāṣim. Hafizi-visningen förlorade allt stöd efter fallet av Fatimid-dynastin: dagens Musta'liyya är alla Ṭayyibiyyah. Den största Mustaali-gruppen är Bohra, och den största Bohra-gruppen är Dawoodi Bohra, som främst finns i Indien. Namnet Bohra är en omtolkning av Gujarati-ordet vahaurau ("att handla"). Bohrā-folket består av två huvudgrupper: en huvudsakligen handelssklass Shī'ī-majoritet och en Sunnī-minoritet som huvudsakligen är bondebönder. "
Shia och Ismaili är ganska lika i deras tro och kulturer, eftersom Ismailis är en del av shia-sekten. Alla sekter delar samma tro om Allah och Muhammad. Allah är trodde den ena och sanna Gud, med Muhammad som Guds sista profet.
